متن پیام رئیس دستگاه قضا به این شرح است:
"انّا للّه و انّا الیه راجعون
إِذَا مَاتَ الْعَالِمُ ثُلِمَ فِی الْإِسْلَامِ ثُلْمَةٌ لَایَسُدُّهَا
ارتحال شیخ المراجع حضرت آیتالله العظمی صافی گلپایگانی، موجب تأسف و تأثر گردید.
سراسر عمر نورانی و بابرکت این عالم برجسته و فقیه مکتب آلالله علیهم السلام و بهخصوص در مدت زمانی که از سوی بنیانگذار انقلاب اسلامی امام راحل(ره) در شورای محترم نگهبان حضور داشتهاند، همواره منشأ خیر کثیر برای حوزههای علمیه، نظام مقدس جمهوری اسلامی و مردم شریف ایران بوده است.
اینجانب مصیبت فقدان این مرجع عظیمالشأن را به پیشگاه حضرت بقیة الله الاعظم ارواحنا فداه و نائب بر حقش حضرت آیتالله العظمی خامنهای (مدّ ظلّه العالی)، مراجع معظم تقلید و علمای عظام و فضلای حوزههای علمیه و عموم شیعیان، ارادتمندان و مقلدان ایشان و بهویژه به بیت شریف معظمله تسلیت میگویم و برای ایشان از درگاه خداوند متعال علو درجات و غفران واسعه و برای بازماندگان و منسوبان، اجر جزیل و صبر جمیل مسئلت مینمایم."
گفتنی است؛ برخی دیگر از مقامات عالی دستگاه قضا در پیامهای جداگانه ارتحال حضرت آیتالله صافی گلپایگانی را تسلیت گفتهاند.