موزه مصر نخستینبار در سال ۱۹۰۲ میلادی، در نزدیکی میدان تحریر، در مرکز قاهره تأسیس شد. آثاری که در این موزه نگهداری میشود، از دوران پیش از تاریخ تا امپراتوری روم را در بر میگیرد. با این حال بیشتر آثار این موزه به عصر فراعنه تعلق دارد.[۴] موزه مصر در سال ۱۹۰۶ میلادی، به ساختمان دو طبقه کنونی منتقل شد.[۳]
در تاریخ ۲۸ ژانویه ۲۰۱۱ و در اوج دورهای از آشوب منتهی به انقلاب مصر، تعداد ۱۸ شی از اشیاء عتیقه از موزه مصر ربوده شدند